Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syt6Q9R0N8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syt6Q9R0N8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms