Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod1Q9R0E2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms