Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms