Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gpc6Q9R087 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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