Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a4Q9QZR9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Col4a4Q9QZR9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a4Q9QZR9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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