Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms