Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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