Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abt1Q9QYL7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abt1Q9QYL7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms