Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnckQ9QYK9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms