Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms