Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms