Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms