Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms