Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl2Q9QUK0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms