Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms