Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms