Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms