Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms