Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb1Q9JLC3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms