Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms