Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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