Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Habp4Q9JKS5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms