Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ldb3Q9JKS4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms