Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx5Q9JKQ4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms