Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pole3Q9JKP7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pole3Q9JKP7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pole3Q9JKP7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms