Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms