Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms