Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cngb3Q9JJZ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cngb3Q9JJZ9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cngb3Q9JJZ9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cngb3Q9JJZ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cngb3Q9JJZ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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