Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms