Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms