Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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