Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms