Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms