Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Tmod3Q9JHJ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Tmod3Q9JHJ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Tmod3Q9JHJ0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Tmod3Q9JHJ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod3Q9JHJ0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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