Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn19Q9ET38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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