Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim39Q9ESN2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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