Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms