Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DysfQ9ESD7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms