Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms