Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParvbQ9ES46 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParvbQ9ES46 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms