Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lima1Q9ERG0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lima1Q9ERG0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms