Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn2Q9ER65 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms