Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3a2Q9EQR4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms