Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r29Q9EQ41 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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