Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv4Q9EPK8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms