Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TnmdQ9EP64 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TnmdQ9EP64 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms