Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab13Q9DD03 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms