Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pop7Q9DCH2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms