Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms