Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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